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蓝藻是养鱼池塘中常见的藻类之一,数量多时易对养殖生产产生危害。
(1）鱼类不喜欢摄食藻类，且难以消化,会影响鱼类对其他饵料生物的利用。
(2）水体生物多样性急剧降低。蓝藻大量繁殖恶化了池水的通风及光照条件，抑制了鱼池中浮游生物有益种类的生长繁殖。
阻碍藻类的光合作用，挤占鱼类易消化吸收藻类的生存空间，使鱼池中的丝状藻和浮游藻等不能合成本身所需要的营养成分而死亡。
(3）蓝藻大量繁殖以及死后藻类的分解，消耗了大量的溶解氧，导致水体缺氧甚至无氧，从而易导致养殖水体发生泛塘。
(4）蓝藻大量死亡时容易败坏水质，容易产生藻毒素、大量羟胺及硫化氢等有毒物质直接危害水生动物。
(5）死亡的蓝藻释放大量的有机质,刺激化能异养细菌的生长,其中部分对鱼类来说是致病菌,导致继发感染细菌性疾病。
(6）蓝藻大量繁殖时，散发腥臭味,影响水体的正常功能。
(7)发生蓝藻水华时水体的理化指标常常超出水生动物的忍受限度,从而引起死亡。
如池塘中蓝藻白天的光合作用，可以使pH上升到10左右，超过一些水生动物的忍受限度而使其死亡。
(8)少用磷肥。
真的蓝藻应对方法：
晴朗天气的中午，充分促进上下水层交流及促使底泥再悬浮释放营养，就成为避免蓝藻水华暴发的有效管理措施。
同样这里不能忽略的是水温分层致使上下水层难以交流，中下水层及底泥中的营养元素难以补充到上表层。
出于养殖管理的需要，在天气晴朗的中午，池塘中都要开启增氧机（多数为叶轮式，涌浪机效果更好些）1～2小时，虽然这些渔业机械在促进上下水层交流方面不充分、不彻底，但对于池水不太深的池塘（水深＜2米），仅仅凭这一点，就可以大大减轻蓝藻水华暴发的强度。
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