① 水产养殖的生态系统的生产者仅由单细胞藻类组成,并且在实际养殖生产过程中,由于养殖者仅关心养殖生物的健康程度,对生产者的生长生存环境及营养需求了解不多,系统中没有及时补充生产者生长所必需的营养元素,加上天气变化,因此造成大多数的养殖水生态系统中的生产者的数量不足且不稳定。
② 水产养殖水生态系统的消费者主要由养殖动物组成,结构简单,并且在系统中占绝对优势。消费者食物来源主要是人工投喂的外源物质而不是完全通过生物链获得,所以与系统中的其它消费者之间也没有捕食与被捕食关系或仅有一些低级简单的关系,不像自然的水生态系统中消费者是完全通过捕食生产者获得,并且它们在营养级别上是相近的。因此各不同的消费者之间也不存在明显的捕食与被捕食关系,也不存在初级消费者、次级消费者及三级消费者等。由此可见,水产养殖的生态系统中的食物链并不完全,物质在系统中得不到充分循环,而自然界中消费者依赖于生态系统的食物链的供给。
③ 水产养殖的生态系统的分解者虽然也是由细菌、真菌等异养型微生物组成,但水产养殖生态系统与自然的水生态系统相比,水质更加恶劣造成生产者不能充分利用分解者降解转化的产物,这些代谢产物反过来抑制分解者的生存生长,限制分解者的种群结构和数量,致使分解者的数量不足且结构不稳定,此外养殖者为了达到防病治病的目的,不时使用化学消毒剂来杀灭病原微生物,但这种方式不仅可以杀灭病原微生物,同时还杀灭对水系统有贡献的分解者,使得原本就数量不足的分解者变得更加贫乏。所以大多数的养殖水生态系统中的分解者是不足且结构不稳定。